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Résumé :
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La présente étude a pour objectifla caractérisation des populations de Septoria spp. sur blé à travers une étude morphologique, pathologique et moléculaire. La caractérisation morphologique des cultures monopycnidiales de 37 isolais de S. tritici (Mycosphaerella garaminicola) et trois isolais de S. nodorum (leptosphaera nodorum} s\'est basée sur la couleur et l\'aspect de la colonie. Sur milieu YMA six couleurs et deux aspects sont mis en évidence. L\'étude du comportement de 14 isolais de S. tritici représentant trois régions marocaines sur 16 variétés différentielles de blé tendre a permis de conclure la présence d\'une grande variabilité entre les isolais étudiés. Le regroupement de ces isolais sur la base du recouvrement pycnidîal a présenté une ressemblance avec la classification obtenue par la technique moléculaire avec révélation de neuf pathotypes. La technique des jeunes feuilles détachées a été employée pour évaluer la virulence de 24 isolais de S. tritici et trois isolats de S. nodorum vis-à-vis de la variété sensible Nesma. Le protocole de cette technique consiste à inoculer des fragments de jeune feuille par une suspension sporale avant de les transférer sur Boites Pétri contenant de l\'agar et du Benzimidazole pour retarder le flétrissement des feuilles. La virulence est jugée par la durée d\'incubation et le pourcentage de la surface foliaire chlorosée et nécrosée. Cette technique a permis la révélation aussi bien des chloroses que des pycnides pendant une période très courte par rapport aux méthodes traditionnelles (quatre jours pour les chloroses et 20 jours pour les pycnides). La technique moléculaire AFLP (Amplified Fragment Lenght Polymorphism) a été utilisée pour déterminer l\'importance et la distribution de la variabilité génétique de 39 isolats de S. tritici dans les régions du Gharb, Saïs-Zaer-Moyen Atlas et le Nord marocain. L\'analyse AFLP a été conduite sur l\'ADN de ces isolats en utilisant trois combinaisons d\'amorces qui ont engendré les profils les plus polymorphes et qui ont été choisies à partir de 14 combinaisons testées. Ces trois combinaisons ont enregistré un total de 436 marqueurs qui montrent une haute variabilité génétique avec identification de 11 pathotypes, 15 haplotypes et 32 allèles spécifiques. Mots clés : Blé ; S. tritici (M. garaminicola) ; S. nodorum (L. nodorum) ; variétés différentielles ; feuilles détachées ; AFLP ; diversité génétique ; virulence ; résistance.
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