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Résumé :
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Etant donné l'importance économique du colza et de la certification des variétés, des marqueurs moléculaires ont été développés afin de renforcer l'utilisation de la caractérisation morphologique. Dans cette optique, l'objectif de notre étude consiste d'une part à étudier la diversité génétique des 22 génotypes de Colza, dont 6 variétés marocaines et 16 variétés étrangères de différentes origines, en utilisant cinq locus micro satellites (SSR) et 20 amorces ISSR, et d'autre part, de comparer le pouvoir discriminant des deux types de marqueurs moléculaires dans l'étude de cette diversité. Les résultats obtenus montrent que les cinq amorces SSR utilisés ont généré un total de 18 allèles. Les amorces Na12A08 et Ni4D09 ont produit le polymorphisme le plus important avec 5 et 4 allèles respectivement. Par ailleurs, l'amorce Na14Ell a présenté le plus faible polymorphisme avec seulement deux allèles amplifiés. Concernant les marqueurs ISSR, l'indice de diversité (PIC) a varié entre 0,295 pour l'amorce FIl à 0,509 pour l'amorce IMA834-2, avec une moyenne de 0,37 par amorce, indiquant ainsi un niveau de diversité génétique moyen. Le nombre de bandes polymorphes amplifiées par les ISSR varie entre 8 pour l'amorce ISSRl et 18 pour les amorces FI et F8. Les indices de similarité des 22 variétés deux-à-deux ont varié de 0,176 à 0.456 pour les ISSR et de 0',056 à 0,722 pour les SSR ce qui pourrait indiquer que les ISSR ont présenté un pouvoir discriminant plus important que les SSR. Cependant, ceci serait dû vraisemblablement au nombre limité de locus SSR utilisé et de leur faible taux de polymorphisme. L'arbre phylogénétique généré par les marqueurs SSR a permis de distinguer deux grands groupes qui renferment chacun huit génotypes. Le groupe A comprend toutes les variétés marocaines (H2, H3, Moufida, Syn 3, Narjisse), en plus des trois variétés étrangères. Le groupe B contient le reste des variétés étrangères. Les marqueurs ISSR ont permis de distinguer trois groupes. Les variétés marocaines sont séparées sur les groupes A et C. Le groupe B englobe la totalité des variétés d'origine Pakistanaise. La variété étrangère Alba s'est distinguée de l'ensemble des génotypes. Certes, la caractérisation moléculaire des 22 variétés a permis de déceler une diversité importante entre les génotypes et de dégager une structuration génétique évidente, mais d'autres études ont fait preuve d'une meilleure caractérisation génétique et cela est dû essentiellement au nombre élevé des marqueurs moléculaires utilisés. Mot clés: Brassica napus L., Diversité génétique, marqueurs moléculaires, SSR, ISSR.
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